Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C12orf66Q96MD2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C12orf66Q96MD2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms