Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM47Q96LD4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM47Q96LD4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.7 ms