Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNX27Q96L92 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX27Q96L92 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms