Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC34Q96HJ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC34Q96HJ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC34Q96HJ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms