Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRMT2BQ96GJ1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRMT2BQ96GJ1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms