Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
L3HYPDHQ96EM0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
L3HYPDHQ96EM0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
L3HYPDHQ96EM0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
L3HYPDHQ96EM0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
L3HYPDHQ96EM0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
L3HYPDHQ96EM0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
L3HYPDHQ96EM0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
L3HYPDHQ96EM0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
L3HYPDHQ96EM0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms