Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms