Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OTUB2Q96DC9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms