Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
OPTNQ96CV9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OPTNQ96CV9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OPTNQ96CV9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms