Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZNF428Q96B54 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ZNF428Q96B54 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms