Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EXOSC8Q96B26 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC8Q96B26 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms