Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTSSAQ969W0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SPTSSAQ969W0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms