Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TOP1MTQ969P6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1MTQ969P6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms