Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF3C6Q969F1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C6Q969F1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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