Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAMP4Q969E2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCAMP4Q969E2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms