Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BHMTQ93088 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BHMTQ93088 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms