Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms