Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DNAAF4Q8WXU2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DNAAF4Q8WXU2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms