Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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COPS9Q8WXC6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COPS9Q8WXC6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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COPS9Q8WXC6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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COPS9Q8WXC6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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