Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DCAF4Q8WV16 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCAF4Q8WV16 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCAF4Q8WV16 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms