Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PATJQ8NI35 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PATJQ8NI35 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms