Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEDD1Q8NHV4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEDD1Q8NHV4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
NEDD1Q8NHV4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms