Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTLL11Q8NHH1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTLL11Q8NHH1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms