Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEST2Q8NFU1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BEST2Q8NFU1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms