Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNNM3Q8NE01 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNNM3Q8NE01 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms