Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CARMIL3Q8ND23 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CARMIL3Q8ND23 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms