Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HJURPQ8NCD3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HJURPQ8NCD3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms