Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USP38Q8NB14 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP38Q8NB14 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms