Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CSGALNACT2Q8N6G5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSGALNACT2Q8N6G5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSGALNACT2Q8N6G5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSGALNACT2Q8N6G5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms