Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC24Q8N4L8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC24Q8N4L8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC24Q8N4L8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms