Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3Y1

FBXW8, F-box/WD repeat-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW8Q8N3Y1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FBXW8Q8N3Y1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
FBXW8Q8N3Y1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms