Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLIP4Q8N3C7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLIP4Q8N3C7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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