Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHOT2Q8IXI1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHOT2Q8IXI1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms