Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC117Q8IWD4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC117Q8IWD4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms