Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HERC6Q8IVU3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERC6Q8IVU3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERC6Q8IVU3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms