Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU6

LINC00523, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00523, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00523Q86TU6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00523Q86TU6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00523Q86TU6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00523Q86TU6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00523Q86TU6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00523Q86TU6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00523Q86TU6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00523Q86TU6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LINC00523Q86TU6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00523Q86TU6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms