Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC11Q7Z392 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC11Q7Z392 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC11Q7Z392 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms