Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OTOP3Q7RTS5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOP3Q7RTS5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms