Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N1

COPS6, COP9 signalosome complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS6Q7L5N1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.54■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.52■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
COPS6Q7L5N1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPS6Q7L5N1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms