Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00173Q6ZV60 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00173Q6ZV60 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms