Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBR3Q6ZT12 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBR3Q6ZT12 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBR3Q6ZT12 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms