Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GBP6Q6ZN66 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GBP6Q6ZN66 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms