Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN08

ZNF66, Putative zinc finger protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF66Q6ZN08 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF66Q6ZN08 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF66Q6ZN08 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms