Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FOXD4L3Q6VB84 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FOXD4L3Q6VB84 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms