Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LINGO4Q6UY18 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LINGO4Q6UY18 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms