Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VITQ6UXI7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VITQ6UXI7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms