Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VSTM1Q6UX27 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VSTM1Q6UX27 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms