Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms