Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ATRAIDQ6UW56 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRAIDQ6UW56 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms