Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF7Q6Q0C0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF7Q6Q0C0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms